病情分析：两只眼睛瞳孔大小不同且畏光的可能原因包括虹膜疾病、神经系统问题、药物影响以及外伤引起的损伤。以下分点展开说明这些可能的原因：
1.虹膜疾病
虹膜是控制瞳孔大小的肌肉结构，如果一侧的虹膜出现病变，如炎症、感染或先天性异常，可能导致两侧瞳孔大小不一致。这些变化可能伴随有光敏感，即畏光现象。虹膜疾病较为常见的有虹膜炎、虹膜退化等。
2.神经系统问题
瞳孔大小的调节依赖于自主神经系统，交感神经和副交感神经共同作用。如果由于脑部病变、脑肿瘤或中风等原因导致神经传导发生障碍，可能出现瞳孔不等大并伴有畏光。一些神经系统的疾病如霍纳综合征，也会导致瞳孔缩小和对光反应改变。
3.药物影响
某些药物具有直接或间接影响瞳孔大小的作用。例如，阿托品等抗胆碱能药物可以导致瞳孔扩大，而一些麻醉剂和镇静剂可能导致瞳孔缩小。如果仅一只眼受到了药物影响，则可能导致双眼瞳孔大小不等。药物也可能引起视觉敏感度增加，从而导致畏光。
4.外伤引起的损伤
头部或眼球的外伤可能导致局部神经或肌肉的损伤，从而影响瞳孔的正常功能。创伤后可能发生瞳孔不等大的情况，有时伴随有对光线的敏感性增加。这种情况通常是急性的，需要及时就医处理。
对于上述情况，若发现瞳孔大小不一致并伴有畏光，应尽快进行专业医疗咨询与检查，以查明具体原因并得到适当治疗。特别是在伴随其他症状如视力模糊、头痛、恶心等情况下，更需要警惕潜在的严重疾病。避免长期暴露在强光下，佩戴防护眼镜可能会有所帮助，但最终还是需要根据医生的指导确定具体治疗方案。
