手淫射精时尿道疼痛可能由以下几个原因引起：尿路感染是一个常见的原因。细菌或其他微生物感染尿道可能导致炎症和疼痛。这种情况通常伴随尿频、尿急、尿痛等症状。性传播感染也是一个可能因素，例如淋病或衣原体感染，这些感染可能影响尿道并导致不适。第三，前列腺炎可能是另一种引发尿道疼痛的原因。前列腺炎可能由于细菌感染或其他非感染性因素引起，会导致下腹部疼痛和尿道不适。尿道损伤或刺激，如过度摩擦或使用刺激性的润滑剂，也可能导致疼痛。
当出现尿道疼痛时，应注意观察是否伴随其他症状，如分泌物异常、尿液变化或全身不适。如果症状持续或加重，应及时咨询医疗专业人士进行诊断和治疗，以避免潜在并发症。保持良好的个人卫生习惯和安全的性行为可以帮助预防许多尿道相关问题。